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羽毛降解菌的篩選鑒定及轉(zhuǎn)錄組分析

發(fā)布時(shí)間:2025-11-25 16:21:00 來(lái)源:洛陽(yáng)歐科拜克生物技術(shù)股份有限公司

摘要:【目的】從自然環(huán)境中篩選、鑒定*降解羽毛細(xì)菌,并通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)篩選該菌株中差異表達(dá)基因(DEGs),以探明其降解羽毛的分子機(jī)制?!痉椒ā坷妹坊恫蓸臃ú杉L(zhǎng)期堆放羽毛的土壤,利用羽毛發(fā)酵培養(yǎng)基篩選分離可*降解羽毛的細(xì)菌,對(duì)其進(jìn)行形態(tài)學(xué)描述和分子生物學(xué)鑒定。以篩選菌株為研究對(duì)象,將其分別接種于羽毛發(fā)酵培養(yǎng)基(試驗(yàn)組)和LB培養(yǎng)基(對(duì)照組)中,培養(yǎng)36 h后收集2個(gè)處理組菌體進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,之后對(duì)試驗(yàn)組與對(duì)照組中DEGs進(jìn)行篩選,利用GO功能注釋和KEGG富集分析對(duì)DEGs進(jìn)行注釋?zhuān)剿鱀EGs在羽毛降解菌降解過(guò)程中起關(guān)鍵作用的功能和通路?!窘Y(jié)果】篩選得到1株*降解羽毛的菌株XS6,培養(yǎng)24 h后其能將羽毛發(fā)酵培養(yǎng)基(羽毛10.0 g/L)中羽枝降解97*,角蛋白酶活性為201.2 U/mL;且培養(yǎng)36 h后,在培養(yǎng)基中檢測(cè)到了亞硝酸鹽。經(jīng)形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)鑒定,菌株XS6為白色芽孢桿菌。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果表明,在2個(gè)處理組之間共篩選出655個(gè)DEGs,其中表達(dá)上調(diào)基因148個(gè),表達(dá)下調(diào)基因507個(gè)。GO功能注釋結(jié)果顯示,DEGs注釋到3大類(lèi)32個(gè)功能組中,其中與代謝過(guò)程、細(xì)胞過(guò)程、細(xì)胞、細(xì)胞部分、催化活性有關(guān)的基因注釋較多。KEGG富集分析結(jié)果顯示,DEGs主要在能量和物質(zhì)代謝途徑、信號(hào)傳導(dǎo)途徑、生物合成途徑富集?!窘Y(jié)論】成功獲得了1株*降解羽毛的白色芽孢桿菌XS6,其在降解羽毛過(guò)程中參與了菌株間的協(xié)同作用、能量代謝以及生物大分子物質(zhì)的合成。

鏈接:https://kns.cnki.net/kcms2/organ/detail?v=SHX-2ztJhddfWLGx5EiJgHphiSdK2U6d7g3sWWYDyZM525NgHx8e5DJAJJikT-WnPaXo0LyVvPylB5S9fR4iwIPqXmbbPw_ogU7-SdUUcU57fu7vVrahcpAQgnrbKAj9mX8Bjs8ZdbspbGSnZLNR0Gd1KRpDJzsV7iyIwewLgHVA8PskmQQbnUv5Zo18ev71h9LN1jqDo2SVmiPOfzCCVpFICzpzbaUMn4oLaLYjUSfA1JP7r5EC3636POYCJ3xRmFDmpfNozATLzAdoyFwAcA==&uniplatform=NZKPT&language=CHS


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